Creativity pervades human life. It is the mark of individuality, the vehicle of self-expression, and the engine of progress in every human endeavor. It also raises a wealth of neglected and yet evocative philosophical questions: What is the role of consciousness in the creative process? How does the audience for a work for art influence its creation? How can creativity emerge through childhood pretending? Do great works of literature give us insight into human nature? Can a computer program really be (...) creative? How do we define creativity in the first place? Is it a virtue? What is the difference between creativity in science and art? Can creativity be taught? The new essays that comprise The Philosophy of Creativity take up these and other key questions and, in doing so, illustrate the value of interdisciplinary exchange. Written by leading philosophers and psychologists involved in studying creativity, the essays integrate philosophical insights with empirical research. CONTENTS I. Introduction Introducing The Philosophy of Creativity Elliot Samuel Paul and Scott Barry Kaufman II. The Concept of Creativity 1. An Experiential Account of Creativity Bence Nanay III. Aesthetics & Philosophy of Art 2. Creativity and Insight Gregory Currie 3. The Creative Audience: Some Ways in which Readers, Viewers and/or Listeners Use their Imaginations to Engage Fictional Artworks Noël Carroll 4. The Products of Musical Creativity Christopher Peacocke IV. Ethics & Value Theory 5. Performing Oneself Owen Flanagan 6. Creativity as a Virtue of Character Matthew Kieran V. Philosophy of Mind & Cognitive Science 7. Creativity and Not So Dumb Luck Simon Blackburn 8. The Role of Imagination in Creativity Dustin Stokes 9. Creativity, Consciousness, and Free Will: Evidence from Psychology Experiments Roy F. Baumeister, Brandon J. Schmeichel, and C. Nathan DeWall 10. The Origins of Creativity Elizabeth Picciuto and Peter Carruthers 11. Creativity and Artificial Intelligence: a Contradiction in Terms? Margaret Boden VI. Philosophy of Science 12. Hierarchies of Creative Domains: Disciplinary Constraints on Blind-Variation and Selective-Retention Dean Keith Simonton VII. Philosophy of Education (& Education of Philosophy) 13. Educating for Creativity Berys Gaut 14. Philosophical Heuristics Alan Hájek. (shrink)

Ontology is one strategy for promoting interoperability of heterogeneous data through consistent tagging. An ontology is a controlled structured vocabulary consisting of general terms (such as “cell” or “image” or “tissue” or “microscope”) that form the basis for such tagging. These terms are designed to represent the types of entities in the domain of reality that the ontology has been devised to capture; the terms are provided with logical defi nitions thereby also supporting reasoning over the tagged data. Aim: This (...) paper provides a survey of the biomedical imaging ontologies that have been developed thus far. It outlines the challenges, particularly faced by ontologies in the fields of histopathological imaging and image analysis, and suggests a strategy for addressing these challenges in the example domain of quantitative histopathology imaging. The ultimate goal is to support the multiscale understanding of disease that comes from using interoperable ontologies to integrate imaging data with clinical and genomics data. (shrink)

The World Trade Organization (WTO) is a multilateral trade organization that, at least partially, governs trade relations between its member states. The WTO (2011a) proclaims that its “overriding objective is to help trade flow smoothly, freely, fairly and predictably.” The WTO is a “treaty-based” organization – it has been constituted through an agreed, legally binding treaty made up of more than 30 articles, along with additional commitments by some members in specific areas. At present, 153 states are members of the (...) WTO, which collectively make up over 97 percent of all trade worldwide (WTO 2011b). Together, the WTO treaty specifies the rights and obligations of its member states. To become a member of the WTO, a state must treat the agreement as a “single undertaking.” Members cannot choose à la carte which agreements – for example, regarding tariffs, or trade in services or intellectual property – they want to accede to and which they do not. Instead, they must take on the obligations of the agreement in toto. The WTO is one of the most consequential governance institutions in the world, a lodestar of political debate about globalization (see globalization), attracting increased interest from moral and political philosophers in recent years (James 2006; Moellendorf 2005; Risse 2007; Brock 2009). (shrink)

Interoperability across data sets is a key challenge for quantitative histopathological imaging. There is a need for an ontology that can support effective merging of pathological image data with associated clinical and demographic data. To foster organized, cross-disciplinary, information-driven collaborations in the pathological imaging field, we propose to develop an ontology to represent imaging data and methods used in pathological imaging and analysis, and call it Quantitative Histopathological Imaging Ontology – QHIO. We apply QHIO to breast cancer hot-spot detection with (...) the goal of enhancing reliability of detection by promoting the sharing of data between image analysts. (shrink)

There are two important ways in which, when dealing with documents, we go beyond the boundaries of linear text. First, by incorporating diagrams into documents, and second, by creating complexes of intermeshed documents which may be extended in space and evolve and grow through time. The thesis of this paper is that such aggregations of documents are today indispensable to practically all complex human achievements from law and finance to orchestral performance and organized warfare. Documents provide for what we can (...) think of as a division of intellectual, instructional, and deontic labour, allowing plans, orders, and obligations to be enmeshed together in a way that often involves the use of diagrammatic elements, as for example in a musical score. (shrink)

GAMETOGÊNESE -/- Emanuel Isaque Cordeiro da Silva Instituto Agronômico de Pernambuco Departamento de Zootecnia – UFRPE Embrapa Semiárido -/- • _____OBJETIVO -/- Os estudantes bem informados, estão a buscando conhecimento a todo momento. O estudante de Veterinária e Zootecnia, sabe que a Reprodução é uma área de primordial importância para sua carreira. Logo, o conhecimento da mesma torna-se indispensável. No primeiro trabalho da série fisiologia reprodutiva dos animais domésticos, foi abordado de forma clara, didática e objetiva os mecanismos de diferenciação (...) sexual dos embriões em desenvolvimento, quais os genes envolvidos nesse processo e tudo mais. Nesse segundo trabalho, a abordagem será teórica, mas também clara, sobre a formação primordial dos gametas femininos e masculinos, através da ovogênese nas fêmeas e a espermatogênese nos machos. Esse trabalho visa levar a importância do processo de formação dos gametas e a produção hormonal das gônadas, bem como o entendimento sobre as interações com o eixo hipotálamo-hipofisário. -/- •____INTRODUÇÃO -/- A reprodução sexual é um processo mediante a qual dois organismos da mesma espécie unem seu material genético para dar lugar a um organismo fixo com combinação única de genes; para isso, cada organismo produz células que contém a metade do material genético característico da espécie. Essas células haploides (1n) são denominadas gametas; ao combinar-se um gameta masculino com um feminino produz-se uma célula diploide (2n) (zigoto ou ovo) a partir da qual se forma o embrião. A grande maioria das espécies com reprodução sexual são anisogâmicas, o que significa que produzem dois tipos de gametas diferentes: os gametas masculinos são microscópios, móveis e produzem-se em grande quantidade, enquanto que os femininos são grandes, imóveis e produzem-se em menor quantidade. O tipo de gameta que um indivíduo produz é o que define seu sexo; sobre os animais o macho é o indivíduo que produz grandes quantidades de espermatozoides e a fêmea produz uma menor quantidade de óvulos, enquanto que nas plantas as gônadas masculinas são as produtoras pólen e as femininas produzem oosferas. Os gametas são diferentes do resto das células do organismo, as quais se chamam células somáticas; essas últimas são diploides porque contém dois pares de cromossomos, um par herdado do pai do indivíduo e o outro da mãe. As células somáticas, ademais, se dividem por mitose, ao qual os cromossomos se duplicam antes de cada divisão celular e cada uma das células filhas recebe um complemento diploide idêntico dos cromossomos, logo todas as células somáticas de um indivíduo possuem o mesmo material genético, embora cada tipo celular expresse diferentes combinações de genes. Em contraponto, os gametas são células haploides porque possuem somente um par de cromossomos e a metade do material genético característico da espécie. Cada um dos cromossomos em um gameta é resultado da recombinação dos genes contidos nos cromossomos paterno e materno do indivíduo que originam o gameta, e cada um destes possuem uma combinação única de genes. Os gametas se formam a partir das células germinais, que são células que em sua origem são diploides e elas de “comprometem” a manter-se como uma linha celular especial que em determinado momento sofrerá o processo de meiose para dar origem aos gametas haploides, sejam óvulos ou espermatozoides segundo o sexo do animal. Como descrito no trabalho sobre a diferenciação sexual, as células germinativas primordiais originam-se no epiblasto do embrião, e migram desde o saco vitelino até colonizar as cristas gonodais, onde, por sua vez, proliferam-se e se organizam junto com as células somáticas da gônada primitiva para formar o testículo ou o ovário. As células germinais masculinas e femininas tem a mesma origem embrionária. As gônadas indiferenciadas em um embrião possuem três tipos celulares: as células que dão origem aos gametas (ovogonia ou espermatogonia), as precursoras de células que nutrem os gametas em desenvolvimento (células da granulosa no ovário; células de Sertoli no testículo) e as precursoras de células que secretam hormônios sexuais (células da teca no ovário; células de Leydig no testículo). As células germinais são as únicas estruturas do organismo que têm a capacidade de dividir-se por meiose sofrendo uma redução no número de seus cromossomos, sendo responsável pela transmissão da carga genética aos descendentes. Em contraste, as células somáticas somente se dividem por mitose. A formação dos gametas compreende fases sequenciais de mitose, meiose e pós-meiose. Esses processos são altamente organizados e necessitam de um preciso e bem coordenado programa de expressão genética. Uma das características importantes da gametogênese é a redução cromossômica, que através da meiose, reduz pela metade o número de cromossomos e produz células distintas entre si, devido a trocas de material genético entre os pares de cromossomos provenientes do pai e da mãe, o que ocorre no processo de “crossing over” durante a primeira fase da meiose. A gametogênese é o processo mediante o qual as células germinais de cada sexo se multiplicam, dividem e diferenciam até formar os gametas. No caso da formação dos gametas masculinos o processo recebe o nome específico de espermatogênese, e para os gametas femininos é denominado como ovogênese. Embora os dois processos alcancem o objetivo comum de produção das células haploides, por onde compartilham algumas características, existem diferenças marcadas entre eles devido a necessidade de produzir um número muito distinto de gametas, de tamanho diferente, e com características de motilidade também distintas. -/- •___ESPERMATOGÊNESE -/- A espermatogênese é o processo mediante o qual se produz os gametas masculinos denominados espermatozoides. Durante a vida fetal as células germinais e as células somáticas do testículo em formação organizam-se em túbulos seminíferos que se derivam dos cordões sexuais primários e conformam a maior parte da medula do testículo. Na etapa fetal cada tubo seminífero é delimitado por uma membrana basal, recoberta na parte interior pelas células precursoras das células de Sertoli (um tipo de células somáticas). No exterior do túbulo localizam-se as células precursoras das células de Leydig ou intersticiais (figura 1), que também são células somáticas. Entre a membrana basal e as células de Sertoli encontram-se algumas células germinais denominadas espermatogonias de reserva A0 (denominadas gonócitos) que serão o único tipo de células germinais presentes no testículo enquanto o animal não alcançar a puberdade. As células de Sertoli estabelecem na região basal uniões oclusoras entre si, formando parte da barreira hemato-testicular. As espermatogonias A0 localizam-se por dentro da membrana basal do túbulo seminífero, embora fora da barreira hemato-testicular. Figura 1: fase neonatal. Nota-se a grande infiltração de tecido intersticial em quase 50% da seção originando que os túbulos sejam pequenos e redondos em sua maioria. O citoplasma e núcleo das células pré-Leydig são notadas claramente por essa ser uma espécie suína onde o tecido intersticial está claramente diferenciado. Hematoxilina-eosina (X 220.5). Fonte: Embrapa. -/- O número de células de Sertoli no testículo depende da influência do hormônio folículo estimulante (FSH) presente durante a vida fetal e as primeiras etapas de vida pós-natal. A população de células de Sertoli ao chegar a puberdade se manterá fixa durante o resto da vida do animal; existe uma relação positiva entre o tamanho e a população de células de Sertoli e a capacidade de produção de espermatozoides do testículo. As células de Sertoli são as únicas células somáticas que estão no epitélio seminífero, e sua função é a nutrição, sustentação e controle endócrino das células germinais. As células de Sertoli participam ativamente no processo de liberação dos espermatozoides para a luz do túbulo. Nesse momento, as células de Sertoli realizam a fagocitose de parte do citoplasma do espermatozoide dos chamados corpos residuais. As células de Sertoli também fagocitam as células germinais que se degeneram no curso normal da espermatogênese. Essas células ainda sintetizam grande quantidade de proteínas, como por exemplo as proteínas ABP (androgen hinding protein), que transportam andrógenos para todo o aparelho reprodutivo, transferrinas, que transportam ferro para a respiração celular das células germinais e também às inibinas, que regulam a liberação de FSH pela hipófise, através de um sistema de retroalimentação (feedback) negativa (figura 2). Figura 2: epitélio seminífero, células de Sertoli (flecha) (400 X). Fonte: Embrapa. -/- Antes da puberdade dos túbulos seminíferos observam-se ao corte como estruturas de diâmetro pequeno, sem luz, e conformados unicamente pelas células de Sertoli e espermatogonias de reserva e rodeados por abundante tecido intersticial, ao que estão presentes as células precursoras das células de Leydig. Ainda antes da puberdade, a diferenciação celular manifesta-se primeiro pela presença de espermatócitos primários, os quais se degeneram em geral na fase de paquíteno, por falta de estimulação hormonal. A partir de que o animal chega a puberdade inicia-se o processo de espermatogênese, que se manterá durante toda a vida do animal, exceto em espécies de animais silvestres muito estacionais, ao qual pode se suspender durante a época não reprodutiva para voltar e ser retomada na época ou estação reprodutiva. Depois da puberdade, os túbulos seminíferos possuem um diâmetro muito maior; em seu interior observa-se um grande número de células germinais de todos os tipos, diferentes estádios de divisão, e em seu lúmen contém líquido e espermatozoides. Ainda sobre o alcancei da puberdade, as espermatogonias começam a dividir-se aceleradamente por mitose, enquanto que no espaço intersticial as células mesenquimais também começam a se diferenciar e a dar origem as células de Leydig (figura 3). A partir dessa etapa as células de Leydig (totalmente diferenciadas) são também evidentes no exterior do túbulo, junto com as células mioides ou peritubulares que o rodeiam o que ao contrair-se são responsáveis por controlar o avanço dos fluidos e as células presentes no lúmen do túbulo. As células mioides estão situadas ao redor do túbulo, e é creditado a elas a promoção da contração e da integridade estrutural do túbulo. Esse tipo celular apenas se diferencia na puberdade pela ação dos andrógenos (figura 4). As interações entre as células de Sertoli e as mioides parecem ter um papel importante na manutenção das funções do testículo. Durante o processo de espermatogênese, as espermatogonias de reserva dividem-se periodicamente e enquanto algumas células fixas permanecem como espermatogonias de reserva, outras proliferam e sofrem uma seção de divisões mitóticas durante as quais se vão diferenciando até formarem espermatócitos primários (espermatocitogênese ou fase de mitose), logo sofrem divisões especiais mediante as quais reduzem seu número de cromossomos (fase de meiose), e ao final trocam de forma para converter-se em espermatozoides (espermatocitogênese) (figura 5). Cada uma dessas etapas da espermato- gênese será descrito detalhadamente adiante, antes é necessário a explicação de algumas características das células de Sertoli e de Leydig que ajudarão a entender seu papel durante a espermatogênese. Figura 3: células de Leydig no espaço intersticial do testículo bovino adulto PAS (400 X). Fonte: Embrapa. -/- Figura 4: o estabelecimento da puberdade pela presença de espermatozoides no túbulo. Hematoxilina-eosina (400 X). Fonte: Embrapa. Figura 5: fases mitóticas das espermatogonias (A0 e B) para formação de um espermatócito primário e as duas fases de meiose que se sucedem antes da espermatogênese. Fonte: ZARCO, 2018. -/- Ao início da espermatocitogênese as uniões oclusoras entre as células de Sertoli se abrem por etapas (como as comportas de um submarino) para permitir a passagem das espermatogonias em direção ao centro do túbulo seminífero sem que se estabeleça uma continuidade entre o exterior e o interior da barreira hemato-testicular. Uma vez ultrapassada essa barreira, as sucessivas gerações de espermatogonias, espermatócitos, espermátides e espermatozoides irão se localizar em direção ao interior do túbulo seminífero, em estreita associação com as células de Sertoli. Em consequência, as células de Sertoli dividem o túbulo seminífero em dois compartimentos; o compartimento basal (debaixo das uniões oclusoras das células de Sertoli), ao qual residem as espermatogonias de reserva, e o compartimento adluminal (em direção ao centro do túbulo), cujos espaços entre as células de Sertoli desenvolvem o resto do processo de espermatogênese (meiose e espermatocitogênese). Esse feito é importante porque durante a vida fetal as únicas células germinais existentes eram as espermatogonias de reserva, pelo que os antígenos expressados por gerações mais avançadas (espermatogonias intermediárias, secundárias, espermátides e espermatozoides) não são reconhecidos como próprios do corpo pelo sistema imunológico. Logo, o anterior implica que deve existir uma barreira entre eles e o sangue para evitar um ataque imunológico. Em todas as etapas da espermatogênese, as células de Sertoli atuam como células de suporte para as células germinais, que sempre permanecem recoberta pela membrana das células de Sertoli. Também atuam como células nutricionais já que proporcionam o meio em que as células germinais se desenvolvem e maturam, assim como as substâncias que regulam e sincronizam as sucessivas divisões e transformações das células germinais. As células de Sertoli produzem hormônios, como estrógenos e inibina que atuam sobre a hipófise para regular a secreção das gonadotropinas que controlam a espermatogênese. As células de Leydig que residem no exterior do túbulo seminífero também são importantes para a espermatogênese: produzem a testosterona que estimula e mantém a espermatogênese, bem como serve como substrato sobre o qual atua como aromatizador das células de Sertoli para transformá-las em estrógenos. Como supracitado, para seu estudo podemos dividir a espermatogênese em três fase: espermatocitogênese, meiose e espermiogênese (figura 6). Agora, serão descritas cada uma dessas etapas. Em algumas espécies, incluindo no homem, os macrófagos representam o segundo tipo celular intersticial mais numeroso no testículo, depois das células de Leydig. Os macrófagos e vários subtipos de linfócitos são identificados nós testículos de ovinos e ratos. Eles estão intimamente associados com as células de Leydig e atuam juntamente na regulação da esteroidogênese. Figura 6: fluxograma da espermatogênese. -/- Espermatocitogênese -/- A espermatocitogênese, também chamada de etapa proliferativa ou de mitose, consiste numa série de divisões mitóticas sofridas pelas células descendentes de uma espermatogonia de reserva. Uma vez que a célula se divide, abandona o estado de reserva e começa um processo de diferenciação. As espermatogonias de reserva (denominadas espermatogonias A0 na rata ou As nos humanos) são células que existem desde a vida fetal e que permanecem mitoticamente inativas durante a infância. Uma vez que alcançam a puberdade começam a dividir-se em intervalos regulares, e as células filhas podem permanecer como espermatogonias de reserva ou abandonar a reserva e ingressar na dita espermatocitogênese. Uma vez abandonada a reserva, as células filhas que vão se formando em cada divisão permanecem unidas por pontes citoplasmáticas, constituindo um clone que se divide sincronicamente. As células que se formam depois de cada divisão continuam sendo espermatogonias, porém cada geração é ligeiramente diferente da anterior. Na rata, por exemplo, as espermatogonias tipo A0 ao dividir-se originam espermatogonias do tipo A1, que em sucessivas divisões formam espermatogonias dos tipos A2, A3 e A4, as quais, por sua vez, sofrem outra mitose para formar espermatogonias intermediárias e uma mais para formar espermatogonias do tipo B. Essas últimas se diferenciam (sem se dividir) em espermatócitos primários, processo em que termina a fase de espermatocitogênese, que literalmente significa processo de geração de espermatócitos. As espermatogonias tipo A0 são a fonte para a contínua produção de gametas. A metade delas se dividem e formam células iguais (as chamadas células tronco) e a outra metade forma as espermatogonias A1, que sofre novas divisões mitóticas e formam os tipos 2, 3 e 4. O tipo A4 sofre mitose para formar a intermediária (A In), que por mitose, forma a tipo B (figura 6). Esses tipos de espermatogonias podem ser identificadas em evoluções histológicas de acordo com sua organização topográfica na membrana basal dos túbulos seminíferos ou mediante seu conteúdo de heterocromatina. Outra maneira de diferenciação se baseia em marcadores moleculares específicos que distinguem as espermatogonias tronco (A0) das demais, com os fins de isolamento, desenvolvimento in vitro e transplante. As tipo B passam por mitose para formarem os espermatócitos primários; estes iniciam a primeira etapa da meiose formando os espermatócitos secundários; na segunda etapa da divisão meiótica, cada espermatócito secundário se divide e formam as chamadas espermátides. Quando o testículo alcança seu desenvolvimento total, a meiose completa-se e as espermátides originadas se convertem em espermatozoides. Um dos maiores sinais característicos desse fenômeno é o alargamento das espermátides e sua migração em direção ao lúmen do túbulo seminífero (figuras 4, 7 e 8). Figura 7: espermatogonias marcadas por imuno-histoquímica, anticorpo monoclonal TGFa (400 x). Figura 8: fases de divisões meióticas (M), espermatócitos em paquíteno (PA) e espermatócitos secundários (ES). -/- Figura 9: estádio posterior a liberação dos espermatozoides na luz do túbulo. Hematoxilina-eosina (400 x). Mediante as seis divisões mitóticas que ocorrem durante a espermatocitogênese se forma potencialmente um clone de 64 espermatócitos primários a partir de cada espermatogonia A que ingressa sobre o processo. Não obstante, algumas células sofrem apoptose em cada uma das etapas do processo, ao qual o número real formado é menor. Em outras espécies produzem-se um transcurso similar de divisões mitóticas sucessivas durante a espermatocitogênese, embora a nomenclatura utilizada possa ser distinta, por exemplo nos bovinos as duas últimas divisões mitóticas dão origem as espermatogonias de tipo B1 e B2. -/- Meiose -/- Uma vez que as espermatogonias B se diferenciam em espermatócitos primários, esses iniciam a etapa de meiose, com uma nova divisão; desta vez a divisão é do tipo meiótica. Ao completar-se a primeira divisão meiótica (meiose I) se obtém os espermató-citos secundários, que ao sofrer a segunda divisão meiótica (meiose II) dão origem as espermátides. Vale salientar que a meiose é o processo mediante o qual reduz-se a metade do número de cromossomos, pelo que as espermátides que se obtém são células haploides (1n). Os espermatócitos secundários que se formam depois da primeira divisão meiótica contém a metade do número normal de cromossomos, porém a mesma quantidade de DNA já que cada cromossomo é duplo. As espermátides formadas na conclusão da segunda divisão meiótica (figura 7), por sua vez, contém a metade dos cromossomos, e esse já não são duplos, já que se trata de células 1n. Também deve-se enfatizar que durante a meiose é relevante o entrecruzamento dos cromossomos homólogos, pelo que cada espermátide possui uma combinação única e diferente de genes paternos e maternos. Outro ponto que deve ser levado em consideração é que cada espermátide somente possui um cromossomo sexual; a metade das espermátides contém o cromossomo X herdado da mãe do macho que está levando a cabo a espermatogênese e a outra metade contém o cromossomo Y herdado de seu pai. Para cada espermatócito primário que entra no processo de meiose obtém-se cerca de quatro espermátides, pelo qual ao ser completada a meiose potencialmente se poderiam formar até 256 espermátides por cada espermatogonia que abandona a reserva e ingressa na espermatocitogênese. -/- Espermiogênese -/- Durante a espermiogênese, também chamada de fase de diferenciação, as esper-mátides sofrem, sem se dividir, uma metamorfose que as transforma em espermatozoides, os quais finalmente são liberados das células de Sertoli em direção ao lúmen do túbulo seminífero. A espermiogênese é um processo complicado e longo já que a espermátide deve sofrer complexas trocas nucleares, citoplasmáticas e morfológicas que resultam na forma-ção dos espermatozoides. Algumas dessas mudanças incluem a condensação do material nuclear para formação de um núcleo plano e denso, a eliminação do citoplasma para a constituição de uma célula pequena, a formação de uma estrutura especializada denomi-nada acrossomo ou tampa cefálica, e a formação do pescoço e da cauda (flagelo) do esper-matozoide, do que depende a sua motilidade. Durante a maior parte da espermiogênese, as espermátides se mantém com uma estreita associação com as células de Sertoli; logo, chega-se a observar, então, flagelos que se projetam em direção a luz do túbulo que pare-cem sair das células de Sertoli, sendo na realidade os flagelos dos espermatozoides que ainda não tinham sido liberados pelo lúmen. Ao liberar os espermatozoides em direção a luz do túbulo, as células de Sertoli realizam a fagocitose de parte do citoplasma dos espermatozoides (corpos residuais). Também fagocitam os restos de todas as células germinais que sofrem apoptose ou degeneram-se durante a espermatogênese. Credita-se que ao realizar essas funções as células de Sertoli podem fazer uma monitoração eficiente da espermatogênese, o que lhes permitiria emitir sinais para colaborar na regulação desse processo em nível gonodal e a nível sistêmico através da secreção de hormônios como a inibina e o estradiol. Além da inibina e activina, as células de Sertoli sintetizam outras proteínas, como a ABP (proteína ligadora de andrógenos) que serve como uma molécula de transporte de andrógenos dentro dos túbulos seminíferos, ductos deferentes e epidídimo, ou a transfer-rina, que transporta o ferro necessário para a respiração celular. -/- Resultados da espermatogênese -/- O resultado da espermatogênese não significa apenas uma simples multiplicação das células germinais (até 256 espermatozoides a partir de cada espermatogonia A1), senão que através dela são produzidos gametas haploides pequenos, móveis e com grande diversidade genética entre eles, ao mesmo tempo que se mantêm uma reversa de células mãe (espermatogonias A0) a partir das quais se poderiam originar novos ciclos de esper-matogênese durante o resto da vida do animal. -/- Controle hormonal da espermatogênese -/- Como mencionado, o FSH reproduz um importante papel para o estabelecimento das células de Sertoli durante a vida fetal e início da vida pós-natal. O começo da esper-matogênese também é estimulado pelo FSH, que atua sobre as células de Sertoli para estimular sua função e a ativação de sinais dessas células em direção as células germinais, incluindo-as a abandonar a reserva e ingressar na espermatogênese. O FSH, assim mesmo, estimula a mitose durante o resto da espermatogênese e aumenta a eficiência do processo, já que reduz a apoptose e a degeneração de espermatogonias intermediárias e do tipo B. O FSH também estimula as células de Sertoli para produzirem inibina e ABP. Uma vez iniciada a espermatogênese somente requerem níveis baixos de FSH para se mantê-la. As células de Sertoli também devem ser estimuladas pela testosterona para funcio-nar de maneira adequada; se requer também do LH hipofisário: hormônio que estimula as células de Leydig para produzir testosterona. Por sua vez, a secreção de LH e FSH é regulada pelo GnRH hipotalâmico: esse neurohormônio também faz parte do mecanismo de regulação da espermatogênese. A espermatogênese também é modulada em nível local mediante a produção de determinados fatores e interações entre as células. Dentro dos fatores locais podemos mencionar o fator de crescimento parecido com a insulina 1 (IGF-1), o fator de crescimen-to transformante beta (TGF- β), activina, ocitocina e diversas citocinas. Entre as intera-ções celulares existem tanto uniões de comunicação entre as células de Sertoli e as células germinais, como pontes citoplasmáticas entre todas as células germinais que formam o clone de células descendentes de uma espermatogonia A1. Uma vez que as células de Sertoli iniciam sua função na puberdade é possível manter experimentalmente a espermatogênese somente com testosterona, sem ser requeri-dos nenhum outro hormônio. A quantidade de espermatozoides produzidos, no entanto, é maior quando há presença do FSH. Abaixo do estímulo do FSH as células de Sertoli produzem estradiol e inibina, hormônios que geram uma retroalimentação sobre o eixo hipotálamo-hipofisário para a regulação da secreção de gonadotropinas. Em particular, a inibina reduz a secreção de FSH, pelo qual é factível que sirva como um sinal que evite uma excessiva estimulação as células de Sertoli. -/- Ciclo do epitélio seminífero -/- Em cada espécie as espermatogonias de reserva iniciam um novo processo de divi-sões celulares em intervalos fixos: a casa 14 dias no touro; 12 dias no garanhão e a cada 9 dias no cachaço (reprodutor suíno). A nova geração de células que começam a proliferar sobre a base do tubo deslocam-se em direção ao centro do túbulo a geração anterior, que por sua vez deslocam-se as gerações anteriores. Devido as mudanças que vão sofrendo cada geração celular se ajustam a tempos característicos de cada etapa, já que rodas as células em uma determinada seção do túbulo estão sincronizadas entre si pelas células de Sertoli; em cada espécie somente é possível encontrar um certo número de combinações celulares: 14 diferentes combinações no caso da rata, 8 no touro e 6 no ser humano. A sucessão de possíveis combinações até regressar a primeira combinação se conhece como o ciclo do epitélio seminífero. Na maioria das espécies os espermatozoides que são libera-dos em direção a luz do túbulo provém das células que entraram no processo de esperma-togênese quatro gerações antes que a geração que está ingressando nesse momento, pelo que a espermatogênese no touro dura ao redor de 60 dias e um pouco menos em outras espécies domésticas. Significa que os efeitos negativos das alterações na espermatogêne-se podem estar presentes até dois meses depois de que se produziram essas alterações. Como supracitado, geralmente se observa a mesma combinação celular em toda a área de uma determinada secção transversal do túbulo seminífero. No entanto, se fizermos uma série de secções, observa-se que ao longo do túbulo há uma sucessão ordenada de combinações (a primeira em uma determinada secção; a segunda combinação na seguinte secção, e assim sucessivamente em secções subsequentes até regressar a primeira combi-nação. Teremos, então, que ao início da divisão das espermatogonias A1 se produz de forma sincronizada em uma secção do túbulo, e vai-se transmitindo como uma onda peristáltica as secções adjacentes. Esse processo é denominado como onda do epitélio seminífero e graças à esse túbulo seminífero sempre tem secções em todas as etapas da espermatogênese, com o que se alcança uma produção constante de espermatozoides. -/- Alterações da espermatogênese -/- Nas espécies estacionais a espermatogênese, como já mencionado, pode reduzir-se ou inclusive suspender sua atividade fisiológica durante a época não reprodutiva dessas espécimes, porém esse processo fisiológico não pode ser considerado como uma altera-ção. No entanto, a espermatogênese só pode ser alterada pelas enfermidades ou por fatores externos. A principal causa de alterações na espermatogênese é o aumento da temperatura testicular. Por isso, os testículos são localizados na saco escrotal e são “caídos” para fora do corpo como pode-se observar nos bovinos, caprinos, ovinos, caninos e no próprio homem. A temperatura testicular deve estar cerca de 2 a 6 °C abaixo da temperatura corporal normal. As células germinais masculinas são sensíveis ao calor, pelo qual na maioria dos mamíferos os testículos se encontram fora da cavidade abdominal e existe um sofisticado sistema de termorregulação para mantê-los a uma temperatura menor que a corporal. Se a temperatura corporal for elevada ou se os testículos permanecerem na cavidade abdominal, ou ainda se os sistemas termorreguladores do testículo sejam afetados por fatores inflamatórios como edema ou falta de mobilidade testicular dentro do escroto, a temperatura do tecido testicular aumentará e a espermatogênese sofrerá alterações proporcionais ao excesso de temperatura e a duração da elevação. A espermatogênese também pode ser afetada pela exposição a hormônios ou a outras substâncias. É possível que a causa mais comum (sobretudo no homem) seja o uso de esteroides anabólicos, que elevam a concentração de andrógenos na circulação, provo-cando um feedback negativo sobre a secreção de gonadotropinas. Ao deixar de estimular-se o testículo pelas gonadotropinas, este deixará de produzir testosterona, e as concentra-ções de andrógeno exógeno nunca alcançará as altíssimas concentrações de testosterona que normalmente estão presentes a nível do tecido testicular por ser o local onde se produz o hormônio. Também se supõe que diversas substâncias com propriedades estrogênicas derivadas de processos industriais (indústria dos plásticos, hidrocarbonetos etc.) e presentes no ambiente (fatores xenobióticos) podem ser responsáveis pelas alterações na espermatogênese em diversas espécies, entre as quais se inclui o ser humano. -/- • OVOGÊNESE E FOLICULOGÊNESE -/- A ovogênese é o processo seguido pelas células germinais da fêmea para a forma-ção dos óvulos, que são células haploides. Durante a vida fetal as células germinais proliferam-se no ovário por mitose, formando um grande número de ovogonias, algumas das quais se diferenciam em ovócitos primários que iniciam sua primeira divisão meiótica para deter-se na prófase da divisão. Somente alguns desses ovócitos primários retornarão e concluirão a primeira divisão meiótica em algum momento da vida adulta do animal, dando origem a um ovócito secundário e a um corpo polar. O ovócito secundário inicia a sua segunda divisão meiótica, a qual volta a ficar suspensa até receber um estímulo apropriado, já que somente os ovócitos secundários que são ovulados e penetrados por um espermatozoide retornam e concluem a segunda divisão meiótica, dando origem a um óvulo (figura 10). O processo de ovogênese é realizado dentro dos folículos ovarianos, que também tem que sofrer um longo transcurso de desenvolvimento e diferenciação denominado foliculogênese pelo que a ovogênese como tal realiza-se dentro do marco desse último processo. Por essa razão, na seguinte seção descreverei tanto a ovogênese como a folicu-logênese, e a relação que existe entre ambos. Figura 10: representação da ovogênese. Na etapa de proliferação, as células germinais se diferen-ciam por mitose. A meiose I se caracteriza por uma prófase prolongada, ocorrendo a duplicação do DNA. Nas duas divisões, que ocorrem antes da ovulação e depois da fertilização, a quantidade de DNA é reduzida a 1n, com o fim de que a fusão dos pronúcles (singamia) pós-fertilização, seja gerado um zigoto com um número de cromossomos de 2n (diploide). -/- Geração de ovócitos primários e folículos primordiais Tanto a ovogênese como a foliculogênese iniciam-se durante a vida fetal, quando as células germinais primordiais provenientes do saco vitelino colonizam a gônada primitiva e, junto com as células somáticas z organizam-se para a formação dos cordões sexuais secundários, que se desenvolvem principalmente no córtex do ovário. Nesse período, as células germinais que colonizaram o ovário sofrem até 30 divisões mitóticas, proliferando-se até formar milhares ou milhões de ovogonias, que inicialmente formam “ninhos” constituídos cada um deles por um clone de várias ovogonias que descendem da mesma célula precursora e que se mantêm unidas por pontes citoplasmáticas, sincronizan-do suas divisões mitóticas. Nessa etapa alcança-se a máxima população de células germinais no ovário, que antes de nascer se reduzirá drasticamente por apoptose. No ovário do feto humano chegam a haver até sete milhões de células germinais que ao nascimento se reduzem a dois milhões. Os ovários fetais do bovino, de maneira análoga, chegam a ter até 2.100.000 células germinais, que ao nascimento reduzem para 130.000 aproximadamente. A redução no número de ovogonias produz-se ao mesmo tempo que essas células, que vêm dividindo-se por mitose e estão agrupadas em ninhos, iniciam sua primeira divisão meiótica para se transformarem em ovócitos primários: células germinais que se encontram em uma etapa de suspensão (diplóteno) da prófase da primeira divisão meiótica. Nesse período produz-se uma grande proporção de células germinais; as células somáticas dos cordões sexuais, por sua vez, emitem projeções citoplasmáticas que separam a isolam os ovócitos primários sobreviventes, ficando cada um deles rodeados por uma capa de células aplanadas da (pré) granulosa. Ao mesmo tempo em que se forma uma membrana basal entre as células da granulosa e o tecido intersticial do ovário. Ao ovócito primário rodeado de uma capa de células da (pré) granulosa aplanadas e delimita-das por uma membrana basal denomina-se de folículo primordial (figura 11). Nas vacas os folículos primordiais bem formados já estão presentes nos ovários a partir do dia 90 da gestação. A maioria dos folículos primordiais com os que nasce uma fêmea se manterão inativos durante um longo tempo; muitos deles durante toda a vida do animal. Nos folículos primordiais inativos tanto os ovócitos primários como as células da granulosa conservam sua forma original e mantém um metabolismo reduzido estritamente ao mínimo necessário para manter-se viáveis. Por essa razão, ao realizar um corte histológico de qualquer ovário as estruturas mais numerosas que se observam serão os folículos primordiais. No entanto, cada dia da vida de um animal, inclusive desde a vida fetal, um certo número de folículos primordiais reiniciam seu desenvolvimento, e a partir desse momento um folículo exclusivamente pode ter dois destinos: o primeiro, prosseguir seu desenvolvi-mento até chegar a ovular, e o segundo (que é muito mais frequente) encontrar em algum momento condições inadequadas que fazem fronteira com ele para parar seu desenvolvi-mento, levando-o a sofrer atresia e degenerar até desaparecer do ovário. Figura 11: sequência da foliculogênese apresentando as diferentes estruturas que podemos encontrar em cada fase. Fonte: ZARCO, 2018. Culminação da ovogênese A ovogênese somente se completará quando um ovócito primário reinicia a meio-se; completa sua primeira divisão meiótica para formar um ovócito secundário e um primeiro corpo polar e, quando, finalmente sofrer uma segunda divisão meiótica para formar um óvulo e um segundo corpo polar. Os óvulos são as células 1n que constituem os gametas femininos, pouco numerosos, grandes e imóveis. A grande maioria dos ovóci-tos primários, como veremos mais adiante, nunca retomam a meiose e, em consequência, não chegam a formar ovócitos secundários, e muitos dos ovócitos secundários tampouco sofrem uma segunda divisão meiótica, pelo que não chegam a formar os óvulos. Ao longo da vida de uma fêmea, na maioria das espécies, menos de 0,1% dos ovócitos primários (um a cada mil) chega a terminar a ovogênese, dando origem a um óvulo. O supracitado deve-se a que a ovogênese somente pode retomar-se e ser completa-da em ovócitos primários que se encontram dentro dos folículos primordiais que (uma vez ativados) vão alcançando diversas etapas de seu desenvolvimento em momentos precisos aos que encontram as condições ideais de oxigenação, nutrição, vascularização e exposição a fatores parácrinos e a exposição a concentrações de hormônios que se requerem para que o folículo continue em cada etapa de seu desenvolvimento com o processo de foliculogênese até chegar a ovular. Qualquer folículo que não esteja nessas condições ao longo do desenvolvimento sofrerá degeneração e atresia, pelo que o ovócito primário em seu interior nunca chegará ao ponto em que pode retomar a primeira divisão meiótica. No que resta da presente seção revisaremos o processo de foliculogênese em cujo marco se desenvolve a ovogênese; havemos que tomar de conta que essa última se limita ao que ocorre nas células germinais (ovogonia, ovócito primário, secundário e óvulo), pelo qual depende intimamente do desenvolvimento do folículo de que essas células formam parte. Em um princípio a ativação do folículo primordial e o desenvolvimento folicular são independentes das gonadotropinas: não se conhecem os mecanismos precisos median-te os quais um folículo primordial se ativa e reinicia seu desenvolvimento, nem como se decide quais folículos, dentre as dezenas de milhares de ou centenas de milhares presentes em um ovário se reativarão em um dia em particular. A reativação trata-se de uma liberação de influência de fatores inibidores, já que os folículos primordiais se reativam espontaneamente quando cultivados in vitro, isolados do resto do tecido ovariano. Uma vez que um folículo primordial se ativa, inicia-se um longo processo de desenvolvimento que somente depois de vários meses (ao redor de cinco meses no caso dos bovinos) o levará a um estádio em que seu desenvolvimento posterior requer a presença das gonado-tropinas; daí que se diz que as primeiras etapas do desenvolvimento são independentes das gonadotropinas. Durante a fase independente de gonadotropinas, um folículo primordial que tenha sido ativado e tenha começado a crescer; passará primeiro para a etapa de folículo primá-rio, caracterizada por conter um ovócito primário que está rodeado, por sua vez, por uma capa de células da granulosa, que não são planas, e sim cúbicas. Depois, se o folículo continuar crescendo se transformará em um folículo secundário, ao qual as células da granulosa começam a proliferar (aumentando em número) e se organizam em duas ou mais capas que rodeiam o ovócito primário. Entre o ovócito e as células da granulosa que o rodeiam se forma nesta uma zona pelúcida; ainda assim o ovócito mantém contato direto com essas células, mediante o estabelecimento de pontes citoplasmáticas que atravessam a zona pelúcida. Através dessas pontes citoplasmáticas as células da granulosa podem passar nutrientes e informação ao ovócito primário. O volume e o diâmetro do ovócito primário aumentam ao mesmo tempo que as células da granulosa proliferam-se, para incrementar as capas ao redor do ovócito. De maneira gradual o citoplasma do ovócito primário aumenta até 50 vezes seu volume e a proliferação das células continua. Esses folículos que possuem cada vez mais células e portanto mais capas de células da granulosa se denominam folículos secundários. Para evitar confusões, há a necessidade de nomen-clatura ao qual o folículo vá mudando de nome de primordial a primário e logo, de secun-dário, a terciário, por sua vez, o ovócito que encontra-se em seu interior, a todo momento, segue sendo um ovócito primário. Durante a etapa dependente de gonadotropinas, os folículos secundários começam a formar um espaço cheio de líquido, o antro folicular, desse modo se convertem em folí-culos terciários. Com a utilização de outra nomenclatura, a formação do antro marca a transição entre folículos pré-antrais (sem antro) e folículos antrais (com antro). Em algum momento dessa transição entre folículo secundário e terciário, também aparece a depen-dência de folículos em direção as gonadotropinas, pelo qual somente podem seguir crescendo na presença do hormônio luteinizante (LH) e do hormônio folículo estimulante (FSH). Nos bovinos e em outras espécies (para seu estudo), os folículos antrais são dividi-dos em pequenos, médios e grandes. Embora todos eles possuam um antro folicular, dependendo do seu grau de desenvolvimento requerem diferentes concentrações de gona-dotropinas para continuar o crescimento. Os folículos antrais mais pequenos somente re-querem concentrações baixas de LH e FSH, pelo qual podem continuar crescendo em qualquer momento do ciclo estral inclusive em animais que não estão ciclando (fêmeas em anestro pré-puberal, gestacional, lactacional, estacional). Nas etapas posteriores os folículos antrais requerem primeiro concentrações elevadas de FSH, e nas etapas finais somente podem continuar crescendo na presença de pulsos frequentes de LH, pelo qual somente os folículos que encontram-se sob concentrações apropriadas desses hormônios podem seguir crescendo. Por essa razão, nos animais que se encontram em anestro de qualquer tipo somente é possível encontrar folículos antrais pequenos ou médios, segundo a espécie, e nos animais que se encontram ciclando (estro) o maior tamanho folicular encontrado em um determinado dia do ciclo dependerá das concentrações de FSH e LH presentes nesse momento e nos dias anteriores. Um folículo que chega ao estado máximo de desenvolvimento, conhecido como folículo pré-ovulatório, ao final, somente chegará a ovular se for exposto a um pico pré-ovulatório de LH. Como supracitado, cada dia na vida de uma fêmea inicia seu desenvolvimento um certo número de folículos; a grande maioria sofrem atresia, mas depois da puberdade em cada dia do ciclo estral um ou vários folículos vão encontrando ao longo do seu desenvol-vimento concentrações hormonais que lhes permite chegar na etapa de folículo pré-ovula-tório. Somente nestes folículos, e como consequência de um pico pré-ovulatório de LH, se reinicia e completa-se a primeira divisão meiótica do ovócito primário, produzindo duas células distintas. Uma delas é o ovócito secundário, que retém praticamente todo o citoplasma. Contém, assim mesmo, em seu núcleo um par de cromossomos duplos, a outra é o primeiro corpo polar, que é exclusivamente um núcleo com uma quantidade mínima de citoplasma. Na maioria das espécies ovula-se um ovócito secundário que se encontra, então, suspendido na segunda divisão meiótica. Esta segunda divisão meiótica somente reinicia-rá e completarar-se uma vez que o espermatozoide começa a penetrar sob o ovócito secundário. Ao concluir-se a divisão se forma o segundo corpo polar e completa-se a ovogênese com o qual se obtém o óvulo, célula 1n que constitui o gameta feminino. No entanto, o óvulo existe pouco tempo como tal, já que em poucos minutos/horas (depen-dendo da espécie) se produzirá a fusão do núcleo do mesmo (pró-núcleo feminino) com o do espermatozoide (pró-núcleo masculino), com o qual se completa a fertilização e se forma um novo indivíduo (o ovo ou zigoto). -/- Ondas foliculares -/- Como mencionado supra, todos os dias um determinado número de folículos pri-mordiais se ativam e começam a crescer, os quais crescem em um ritmo característico em cada espécie. Isso provoca que em qualquer momento existam nos ovários folículos pri-mordiais (que começam a crescer em alguns dias ou semanas), assim como folículos secundários em diversas etapas do desenvolvimento, os quais iniciaram seu desenvolvi-mento em semanas ou inclusive meses (segundo o grau de desenvolvimento atual). Também em qualquer momento poderá haver folículos antrais nas etapas iniciais de seu desenvolvimento (com antros que já se podem detectar em cortes histológicos mas não são visíveis macroscopicamente). Todos esses folículos chegaram até seu estado de de-senvolvimento atual (primário, secundário ou antral pequeno), independente da etapa do ciclo estral em que sejam observados ou encontrados. Nos bovinos, os folículos que chegam ao início da etapa antral iniciaram seu desenvolvimento cinco meses antes, e todavia requerem ao redor de 42 dias para chegar ao estado pré-ovulatório. Para continuar seu desenvolvimento, os folículos antrais pequenos devem encon-trar concentrações altas de FSH, que os estimulam para prosseguir o crescimento. Cada vez que se produz uma elevação nas concentrações de FSH, esse hormônio estimula o desenvolvimento de um grupo de folículos antrais pequenos, que começaram a crescer muito tempo antes e que o dia da elevação de FSH tenha alcançado o grau de desenvolvi-mento preciso para responder com eficiência a este hormônio, o qual atuará através de seus receptores nas células da granulosa para estimular a produção de estradiol, a secreção de inibina, a produção de líquido folicular e a proliferação das células da granulosa. Um grupo de folículos antrais pequenos é assim recrutado pelo FSH para acelerar seu cresci-mento e aumentar sua produção de estradiol e inibina (figura 12). Mediante um seguimento ultrassonográfico dos ovários é possível identificar pou-cos dias depois um certo número de folículos, que por haver sido recrutados começam um período de crescimento acelerado. Durante alguns dias vários folículos crescem juntos, porém depois um deles é selecionado para continuar crescendo, enquanto que o restante do grupo deixam de fazê-lo e terminam sofrendo atresia. Através da ultrassom é possível identificar o folículo selecionado, agora chamado folículo domi-nante, já que sua trajetória de crescimento sofre um desvio com respeito a seguida pelo restante do grupo. Os folículos que não foram selecionados deixam de crescer e sofrem atresia já que deixam de possuir o suporte gonadotrópico de FSH, uma vez que as concentrações desse hormônio são suprimidos pela inibina e o estradiol produzidos pelo conjunto de folículos que conformam a onda folicular (figura 12), porém o folículo mais desenvolvido do grupo se converterá em dominante. A inibina atua diretamente a nível hipofisário para reduzir a secreção de FSH. Figura 12: onda folicular e relação dos níveis de FSH, estradiol e LH. Fonte: ZARCO, 2018. -/- Figura 13: Recrutamento, seleção e dominação folicular na espécie ovina e influência do FSH e LH nas fases. Fonte: SILVA, E. I. C. da, 2019. -/- A razão pela qual o folículo dominante é capaz de continuar seu desenvolvimento apesar da baixa nas concentrações de FSH é que o folículo é o único que alcançou o grau de progresso necessário para que apareçam os receptores para LH em suas células da granulosa. Esse processo permite ao folículo dominante ser estimulado pela LH, e que requeira baixas concentrações de FSH para manter seu desenvolvimento. A secreção de LH em forma de pulsos de baixa frequência (um pulso a cada quatro a seis horas), característica da fase lútea do ciclo estral; é suficiente para permitir que um folículo dominante continue crescendo por mais dias depois da sua seleção e que mais tarde mantenha-se viável durante alguns dias embora não aumentem de tamanho. Contu-do, se durante o período viável desse folículo não seja finalizada a fase lútea e não diminuam as concentrações de progesterona, o folículo terminará sofrendo atresia devido a exigência de um padrão de secreção acelerada de LH (aproximadamente um pulso por hora) durante o desenvolvimento pré-ovulatório, que somente pode ser produzido com a ausência da progesterona. Uma vez que um folículo dominante sofre atresia deixa de produzir inibina, pelo qual as concentrações de FSH podem elevar-se novamente para iniciar o recrutamento de outro grupo de folículos a partir da qual se origina uma nova onda folicular. Durante o ciclo estral de uma vaca podem gerar-se dois ou três ondas foliculares; somente em raros casos quatro. A etapa de dominância folicular da primeira onda na grande maioria dos casos não coincide com a regressão do corpo lúteo, pelo qual o primei-ro folículo dominante quase invariavelmente termina em atresia. Em algumas vacas o fo-lículo dominante da segunda onda ainda está viável quando se produz a regressão do corpo lúteo e acelera-se a secreção de LH, pelo qual esse segundo folículo dominante se converte em folículo pré-ovulatório e, ao final ovula. Em outros animais o segundo folícu-lo dominante também perde a sua viabilidade antes da regressão do corpo lúteo, por onde nesses animais se inicia uma terceira onda folicular, da qual surge o folículo que finalmen-te ovulará depois de produzir-se a regressão do corpo lúteo. Sem importar a onda em que se origine, uma vez que um folículo dominante é ex-posto a alta frequência de secreção de LH que se produz depois da regressão do corpo lúteo, aumenta ainda mais sua secreção de estradiol até que as altas concentrações desse hormônio comecem a exercer um feedback positivo para a secreção do LH. Isso provoca-rá a aceleração da frequência de secreção do LH até que os pulsos são tão frequentes que começam a ficar por cima e produzir-se o pico pré-ovulatório de LH, que é responsável pela realização da ovulação e a maturação final do ovócito. -/- •___DIFERENÇAS ENTRE ESPERMATOGÊNESE E OVOGÊNESE -/- Enquanto que na fêmea a ovogênese inicia-se durante a vida fetal, no macho a es-permatogênese começa na puberdade. Na fêmea, a partir de um ovócito primário se origi-na um óvulo; no macho, de um espermatócito primário se produzem, teoricamente, quatro espermatozoides. Outra característica interessante é que enquanto a fêmea já conta desde o nasci-mento com todos os ovócitos que necessitará na vida adulta, o macho necessitará chegar a puberdade para iniciar o desenvolvimento das células sexuais, já que ao nascer somente possui gonócitos precursores das células germinais, células de Sertoli e intersticiais. Na vida adulta de uma fêmea, o número de células germinais desaparece paulati-namente. Uma vez iniciada a espermatogênese no macho, a cada ciclo do epitélio seminí-fero as células germinais são renovadas mantendo a provisão para toda a vida reprodutiva. Na fêmea, a meiose sofre duas interrupções em seu transcurso, e no macho é ininterrupta. Figura 14: representação em diagramação comparativa do desenvolvimento da gametogênese. -/- Principais pontos abordados sobre as diferenças entre a gametogênese masculina e feminina: ❙ Na ovogênese a meiose contêm-se em duas ocasiões esperando acontecimentos externos para prosseguir. Já na espermatogênese não existe a suspensão da meiose. ❙ A espermatogênese é um processo contínuo, enquanto que a ovogênese pode completar exclusivamente um óvulo em cada ciclo estral; já que só pode ser completada por mais de um nas espécies que ovulam vários ovócitos no caso das porcas, cadelas, gatas etc. ❙ Na espermatogênese existem células de reserva que permitem a continuação du-rante toda a vida, enquanto que na ovogênese o número de ovócitos primários é limitado. A fêmea somente conta com os que nasceu, e eles não se dividem. ❙ Na espermatogênese obtém-se até 256 espermatozoides para cada espermatogo-nia que inicia o processo, enquanto que na ovogênese somente se obtém um óvulo a partir de cada ovócito primário. ❙ Durante a espermatogênese se produz uma metamorfose que transforma as es-permátides em espermatozoides. Na ovogênese não ocorre um processo análogo. ❙ Na espermatogênese, durante a meiose produzem-se quatro espermátides a partir de cada espermatócito primário. Na ovogênese se produz somente um óvulo a partir de cada ovócito primário; produz, ademais, dois corpos polares. ❙ Todos os óvulos que se produzem durante a ovogênese contém um cromossomo X, enquanto que a metade dos espermatozoides possuem um cromossomo Y e a outra metade um cromossomo X. ❙ Na espermatogênese produzem-se centenas ou dezenas de milhões de esperma-tozoides por dia, enquanto que na ovogênese se produz um ou alguns óvulos a cada ciclo estral. ❙ A espermatogênese produz gametas macroscópicos e com motilidade própria, enquanto que a ovogênese produz gametas grandes e imóveis. -/- REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS -/- ABDEL-RAOUF, Mohammed et al. The postnatal development of the reproductive organs in bullswith special reference to puberty.(Including growth of the hypophysis and the adrenals). Acta endocrinologica, n. Suppl No. 49, 1960. ADONA, Paulo Roberto et al. Ovogênese e foliculogênese em mamíferos. Journal of Health Sciences, v. 15, n. 3, 2013. AERTS, J. M. J.; BOLS, P. E. 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Definitions vary according to context of use and target audience. They must be made relevant for each context to fulfill their cognitive and linguistic goals. This involves adapting their logical structure, type of content, and form to each context of use. We examine from these perspectives the case of definitions in ontologies.

To understand what ontologies do through their definitions, we propose a theoretical explanation of the functions of definitions in ontologies backed by empirical neuropsychological studies. Our goal is to show how these functions should motivate (i) the systematic inclusion of definitions in ontologies and (ii) the adaptation of definition content and form to the specific context of use of ontologies.

The notion of function is indispensable to our understanding of distinctions such as that between being broken and being in working order (for artifacts) and between being diseased and being healthy (for organisms). A clear account of the ontology of functions and functioning is thus an important desideratum for any top-level ontology intended for application to domains such as engineering or medicine. The benefit of using top-level ontologies in applied ontology can only be realized when each of the categories identified (...) and defined by a top-level ontology is integrated with the others in a coherent fashion. Basic Formal Ontology (BFO) has from the beginning included function as one of its categories, exploiting a version of the etiological account of function that is framed at a level of generality sufficient to accommodate both biological and artifactual functions. This account has been subjected to a series of criticisms and refinements. We here articulate BFO’s account of function, provide some reasons for favoring it over competing views, and defend it against objections. (shrink)

Human cognitive acts are directed towards entities of a wide range of different types. What follows is a new proposal for bringing order into this typological clutter. A categorial scheme for the objects of human cognition should be (1) critical and realistic. Cognitive subjects are liable to error, even to systematic error of the sort that is manifested by believers in the Pantheon of Olympian gods. Thus not all putative object-directed acts should be recognized as having objects of their own. (...) Broadly, the objects towards which human cognition is directed should be parts of reality in a sense that is at least consistent with the truths of natural science. But such a scheme should also be (2) comprehensive: it should do justice to each sort of object on its own terms, and not attempt to eliminate objects of one sort in favour of objects of other, more favoured sorts. Linguistic and other forms of idealism, as well as Meinongian theories, which assign to each and every referring expression or intentional act an object tailored to fit, yield categorial schemes which fail to satisfy (1). Physicalistic and other forms of reductionism yield categorial schemes which fail to satisfy (2). What follows is a categorial scheme that is both critically realistic and comprehensive. Thus it enjoys some of the benefits of linguistic idealism and physicalism, without (or so it is hoped) the corresponding disadvantages of each. (shrink)

According to the Monist Interpretation of Descartes, there is really only one corporeal substance—the entire extended plenum. Evidence for this interpretation seems to be provided by Descartes in the Synopsis of the Meditations, where he claims that all substances are incorruptible. Finite bodies, being corruptible, would then fail to be substances. On the other hand, ‘body, taken in the general sense,’ being incorruptible, would be a corporeal substance. In this paper, I defend a Pluralist Interpretation of Descartes, according to which (...) there are many corporeal substances. In particular, I show that none of the claims in the Synopsis about incorruptibility and substance entail either that finite bodies are not substances, or that the only corporeal substance is the entire plenum. (shrink)

In a development that has still been hardly noticed by philosophers, a conception of ontology has been advanced in recent years in a series of extra-philosophical disciplines as researchers in linguistics, psychology, geography and anthropology have sought to elicit the ontological commitments (‘ontologies’, in the plural) of different cultures or disciplines. Exploiting the terminology of Quine, researchers in psychology and anthropology have sought to establish what individual human subjects, or entire human cultures, are committed to, ontologically, in their everyday cognition, (...) in much the same way in which philosophers of science have attempted to elicit the ontological commitments of the natural sciences. Thus they have engaged in inquiries designed to establish how folk ontologies (or folk biologies, folk theories of physics, folk psychologies, and so on) develop through infancy and childhood, or to establish the degree to which given elements of folk ontologies reflect universal features of the human cognitive system. In a parallel development, researchers in biomedicine developed what they called 'ontologies' as controlled vocabularies to ensure interoperability of the way in which, for example, genomic data is described in different biological disciplines. We describe in what follows some of the relations between these efforts and the more traditional concerns of philosophers. (shrink)

For anyone approaching the Encheiridion of Epictetus for the first time, this book provides a comprehensive guide to understanding a complex philosophical text. Including a full translation and clear explanatory commentaries, Epictetus's 'Encheiridion' introduces readers to a hugely influential work of Stoic philosophy. Scott Aikin and William O. Stephens unravel the core themes of Stoic ethics found within this ancient handbook. Focusing on the core themes of self-control, seeing things as they are, living according to nature, owning one's roles (...) and fulfilling the responsibilities that those roles entail, the authors elucidate the extremely challenging ideas in Epictetus's brisk chapters. Divided into five distinct parts, this book provides readers with: -/- - A new translation of the Encheiridion by William O. Stephens. - A new introduction to ancient Stoicism, its system of concepts, and the ancient figures who shaped it. - A fresh treatment of the notorious and counter-intuitive 'Stoic paradoxes'. - An accessible overview of the origin and historical context of the Encheiridion. - Detailed commentaries on each chapter of the Encheiridion that clarify its recurring themes and highlight their interconnections. - Careful attention to the presentation of the arguments embedded in Epictetus's aphoristic style. - A thoughtful discussion of serious criticisms of Epictetus's Stoicism and replies to these objections. -/- Written with clarity and authority, Epictetus's 'Encheiridion' provides a foundation from which readers can understand this important text and engage with the fundamental questions of Stoic philosophy and ethics. This guide will aid teachers of Epictetus, students encountering Stoicism for the first time, and readers seeking a greater understanding of Stoic ethics. (shrink)

The COVID-19 pandemic prompted immense work on the investigation of the SARS-CoV-2 virus. Rapid, accurate, and consistent interpretation of generated data is thereby of fundamental concern. Ontologies––structured, controlled, vocabularies––are designed to support consistency of interpretation, and thereby to prevent the development of data silos. This paper describes how ontologies are serving this purpose in the COVID-19 research domain, by following principles of the Open Biological and Biomedical Ontology (OBO) Foundry and by reusing existing ontologies such as the Infectious Disease Ontology (...) (IDO) Core, which provides terminological content common to investigations of all infectious diseases. We report here on the development of an IDO extension, the Virus Infectious Disease Ontology (VIDO), a reference ontology covering viral infectious diseases. We motivate term and definition choices, showcase reuse of terms from existing OBO ontologies, illustrate how ontological decisions were motivated by relevant life science research, and connect VIDO to the Coronavirus Infectious Disease Ontology (CIDO). We next use terms from these ontologies to annotate selections from life science research on SARS-CoV-2, highlighting how ontologies employing a common upper-level vocabulary may be seamlessly interwoven. Finally, we outline future work, including bacteria and fungus infectious disease reference ontologies currently under development, then cite uses of VIDO and CIDO in host-pathogen data analytics, electronic health record annotation, and ontology conflict-resolution projects. (shrink)

In our book, Why Machines Will Never Rule the World, Jobst Landgrebe and I argue that we can engineer machines that can emulate the behaviours only of simple systems, which means: only of those systems whose behaviour we can predict mathematically. The human brain is an example of a complex system, and thus its behaviour cannot be emulated by a machine. We use this argument to debunk the claims of those who believe that large language models are poised to achieve (...) a level of intelligence that will equal or even surpass that of the human brain. The essay was published under the title "Why Machines Will Never Rule the World". (shrink)

Long-standing neglect of the chemical senses in the philosophy of perception is due, mostly, to their being regarded as ‘lower’ senses. Smell, taste, and chemically irritated touch are thought to produce mere bodily sensations. However, empirically informed theories of perception can show how these senses lead to perception of objective properties, and why they cannot be treated as special cases of perception modelled on vision. The senses of taste, touch, and smell also combine to create unified perceptions of flavour. The (...) nature of these multimodal experiences and the character of our awareness of them puts pressure on the traditional idea that each episode of perception goes one or other of the five senses. Thus, the chemical senses, far from being peripheral to the concerns of the philosophy of perception, may hold important clues to the multisensory nature of perception in general. (shrink)

We have now reached the point at which cloud computing and other types of advanced infrastructure are bringing about a situation in which knowledge objects can be delivered in an efficient manner to hose who need to consume them. And just as highways were the infrastructure necessary for a manufacturing economy, serving as the arteries along which raw materials and manufactured goods coming in from all directions could flow, so we believe that ontologies will in the future provide an important (...) pillar in the infrastructure that is necessary for the accurate and safe delivery of all varieties of knowledge. (shrink)

It is plausible that there are epistemic reasons bearing on a distinctively epistemic standard of correctness for belief. It is also plausible that there are a range of practical reasons bearing on what to believe. These theses are often thought to be in tension with each other. Most significantly for our purposes, it is obscure how epistemic reasons and practical reasons might interact in the explanation of what one ought to believe. We draw an analogy with a similar distinction between (...) types of reasons for actions in the context of activities. The analogy motivates a two-level account of the structure of normativity that explains the interaction of correctness-based and other reasons. This account relies upon a distinction between normative reasons and authoritatively normative reasons. Only the latter play the reasons role in explaining what state one ought to be in. All and only practical reasons are authoritative reasons. Hence, in one important sense, all reasons for belief are practical reasons. But this account also preserves the autonomy and importance of epistemic reasons. Given the importance of having true beliefs about the world, our epistemic standard typically plays a key role in many cases in explaining what we ought to believe. In addition to reconciling (versions of) evidentialism and pragmatism, this two-level account has implications for a range of important debates in normative theory, including the interaction of right and wrong reasons for actions and other attitudes, the significance of reasons in understanding normativity and authoritative normativity, the distinction between ‘formal’ and ‘substantive’ normativity, and whether there is a unified source of authoritative normativity. (shrink)

This paper applies the ontological framework developed by Roman Ingarden in his Controversy over the Existence of the World to the domain of mathematics, concluding with some remarks on parallels between the mode of existence of mathematical entities on the one hand and of values on the other.

How, as Caldwell puts it, does one choose between rival systems all of which claim to rest on a priori foundations? On the nonfallibilistic conception it is difficult to make sense even of the possibility of rival systems of this sort. On the conception here defended, in contrast, the existence of such rival systems can be seen to be a perfectly natural and acceptable consequence of the just-mentioned difficulties we will often fact in coming to know even the intelligible traits (...) of reality: one adjudicates between such systems in the same way in which one adjudicates between all rival scientific hypotheses, namely via a complex mixture of empirical and a priori considerations. (shrink)

I present a counterexample to Kirk-Giannini’s Dilemmatic Theory of gaslighting.

In a well-known paper, Reginald Jackson expresses a sentiment not uncommon among readers of Locke: “Among the merits of Locke’s Essay…not even the friendliest critic would number consistency.”2 This unflattering opinion of Locke is reiterated by Maurice Mandelbaum: “Under no circumstances can [Locke] be counted among the clearest and most consistent of philosophers.”3 The now familiar story is that there are innumerable inconsistencies and internal problems contained in Locke’s Essay. In fact, it is probably safe to say that there is (...) not another canonical, well-respected, and seminal philosopher whose work is so widely thought to be swarming with inconsistencies. I, however, do not think that the common, unflattering view of Locke is accurate as a general view of the Essay. But despite my wishes to the contrary, I do believe that Locke’s chapter ‘Of Identity and Diversity’ (2.27)4 leads to (at least) one intractable problem, a problem that is the subject of this paper. (shrink)

This paper is in two parts. Part 1 examines the phenomenon of making space as a process involving one or other kind of legal decision-making, for example when a state authority authorizes the creation of a new highway along a certain route or the creation of a new park in a certain location. In cases such as this a new abstract spatial entity comes into existence – the route, the area set aside for the park – followed only later by (...) concordant changes in physical reality. In Part 2 we show that features identified in studying this phenomenon of legal spacemaking can be detected in other spheres of human activity, for example in planning (where spacemaking is projected into the future), and in reasoning about history (where spacemaking is projected back through time). We shall see that these features display themselves in especially complex ways in our everyday use of language, and we conclude by examining the implications of this complexity for attempts to create an artificial intelligence that would enjoy a mastery of language that would be equivalent to that of human beings. (shrink)

There are two ways to characterize symmetric relations. One is intensional: necessarily, _Rxy_ iff _Ryx_. In some discussions of relations, however, what is important is whether or not a relation gives rise to the same completion of a given type (fact, state of affairs, or proposition) for each of its possible applications to some fixed relata. Kit Fine calls relations that do ‘strictly symmetric’. Is there is a difference between the notions of necessary and strict symmetry that would prevent them (...) from being used interchangeably in such discussions? I show that there is. While the notions coincide assuming an intensional account of relations and their completions, according to which relations/completions are identical if they are necessarily coinstantiated/equivalent, they come apart assuming a hyperintensional account, which individuates relations and completions more finely on the basis of relations’ real definitions. I establish this by identifying two definable relations, each of which is necessarily symmetric but nonetheless results in distinct facts when it applies to the same objects in opposite orders. In each case, I argue that these facts are distinct because they have different grounds. (shrink)

A collection of material on Husserl's Logical Investigations, and specifically on Husserl's formal theory of parts, wholes and dependence and its influence in ontology, logic and psychology. Includes translations of classic works by Adolf Reinach and Eugenie Ginsberg, as well as original contributions by Wolfgang Künne, Kevin Mulligan, Gilbert Null, Barry Smith, Peter M. Simons, Roger A. Simons and Dallas Willard. Documents work on Husserl's ontology arising out of early meetings of the Seminar for Austro-German Philosophy.

Relevance logic has become ontologically fertile. No longer is the idea of relevance restricted in its application to purely logical relations among propositions, for as Dunn has shown in his (1987), it is possible to extend the idea in such a way that we can distinguish also between relevant and irrelevant predications, as for example between “Reagan is tall” and “Reagan is such that Socrates is wise”. Dunn shows that we can exploit certain special properties of identity within the context (...) of standard relevance logic in a way which allows us to discriminate further between relevant and irrelevant properties, as also between relevant and irrelevant relations. The idea yields a family of ontologically interesting results concerning the different ways in which attributes and objects may hang together. Because of certain notorious peculiarities of relevance logic, however,1 Dunn’s idea breaks down where the attempt is made to have it bear fruit in application to relations among entities which are of homogeneous type. (shrink)

Abstract The values of the healthcare sector are fairly ubiquitous across the globe, focusing on caring and respect, patient health, excellence in care delivery, and multi-stakeholder collaboration. Many individual pharmacists embrace these core values. But their ability to honor these values is significantly determined by the nature of the system they work in. -/- The paper starts with a model of the prevailing pharmacist workforce model in Scotland, in which core roles are predominantly separated into hierarchically disaggregated jobs focused on (...) one professional ‘pillar’: Clinician /Practice Provider; Educator; Leader/Manager; and Researcher. This is the ‘Atomistic’ Model. This skills-segregation yields a workforce of individuals working in isolation rather than collaborating together, and lacking a shared information flow, purpose and identity. Key strategic flaws include suboptimal responsiveness to population and subpopulation needs, inconsistency and inequity of care, an erosion of professional agency, and lower job satisfaction. It is conjectured that this results from a lack of congruence between values, professional ethos, and organizational structure. ‘Atomism’ culminates in a syndrome of widespread professional-level cognitive dissonance. -/- The paper contrasts this with a new emerging workforce vision, The Collaborative Care Model. This new model defines a systems-first-approach, built on the principle that all jobs must include all four professional ‘pillars’. Vertical skills integration, involving education and task sharing, will support sustainability and succession planning. Horizontal skills integration (across practice, leadership and research) is included to improve responsiveness to population need and individual professional agency. The working conditions, supportive ethos, and career structure needed to make the model work are described. Moral theory and workforce theory are used to justify why the model may be more effective for population health, delivering greater job satisfaction for individuals and ultimately helping systematically realize and honor healthcare values. Finally, the paper sketches the first steps needed to implement the model at the national level, starting with the operationalization of new multi-pillar professional curricula across the career spectrum. Potential pitfalls and challenges are also discussed. -/- Co-Authors: 1. Paul Forsyth (PF) Lead Pharmacist Clinical Cardiology, Pharmacy, NHS Greater Glasgow & Clyde. Contribution: Conceptualization; Model Curation; Model Theory; Model Visualization; Writing - original draft (lead author), Writing - review & editing (lead author) 2. Andrew Radley (AR), Consultant in Public Health Pharmacy, NHS Tayside. Contribution: Conceptualization; Model curation; Model Theory; Writing - review & editing 3. Gordon Rushworth (GR), MPharm MSc FFRPS FRPharmS (Consultant). Programme Director, Highland Pharmacy Education & Research Centre, NHS Highland, Inverness. Contribution: Model curation; Writing - review & editing 4. Fiona Marra (FM) National Lead Clinician Scottish Infection and Immunology Network (SPAIIN) / Advanced Pharmacist HCV / HIV, NHS Greater Glasgow & Clyde. Contribution: Model curation; Writing - review & editing 5. Susan Roberts (SR) Associate Postgraduate Pharmacy Dean, NHS Education for Scotland. Contribution: Model curation; Writing - review & editing 6. Roisin O’Hare (RO) Lead Teacher Practitioner Pharmacist, Northern Ireland University Network, Southern Health and Social Care Trust. Contribution: Model curation; Writing - review & editing 7. Catherine Duggan (CD) Chief Executive Officer, International Pharmaceutical Federation (FIP). Contribution: Model curation; Writing - review & editing 8. Barry Maguire (BM) Senior Lecturer, School of Philosophy, Psychology and Life Sciences, The University of Edinburgh. Contribution: Conceptualization; Model Curation; Model Theory; Model Visualization; Supervision; Writing - original draft (senior academic supervisor), Writing - review & editing (senior academic supervisor) -/- . (shrink)

Studies of the Early Modern debate concerning absolute and relative space and motion often ignore the significance of the concept of true motion in this debate. Even philosophers who denied the existence of absolute space maintained that true motions could be distinguished from merely apparent ones. In this paper, I examine Berkeley's endorsement of this distinction and the problems it raises. First, Berkeley's endorsement raises a problem of consistency with his other philosophical commitments, namely his idealism. Second, Berkeley's endorsement raises (...) a problem of adequacy, namely whether Berkeley can provide an adequate account of what grounds the distinction between true and merely apparent motion. In this paper, I argue that sensitivity to Berkeley's distinction between what is true in the metaphysical, scientific, and vulgar domains can address both the consistency and the adequacy problems. I argue that Berkeley only accepts true motion in the scientific and vulgar domains, and not the metaphysical. There is thus no inconsistency between his endorsement of true motion in science and ordinary language, and his metaphysical idealism. Further, I suggest that sensitivity to these three domains shows that Berkeley possesses resources to give an adequate account of how true motions are discovered in natural science. (shrink)

Efficient markets are alienating if they inhibit us from recognizably caring about one another in our productive activities. I argue that efficient market behaviour is both exclusionary and fetishistic. As exclusionary, the efficient marketeer cannot manifest care alongside their market behaviour. As fetishistic, the efficient marketeer cannot manifest care in their market behaviour. The conjunction entails that efficient market behavior inhibits care. It doesn’t follow that efficient market behavior is vicious: individuals might justifiably commit to efficiency because doing so serves (...) the common good. But efficient market systems nevertheless have significant opportunity costs. The discussion yields a range of desiderata for non-alienated economic organization. (shrink)

Basic Formal Ontology (BFO) is a top-level ontology used in hundreds of active projects in scientific and other domains. BFO has been selected to serve as top-level ontology in the Industrial Ontologies Foundry (IOF), an initiative to create a suite of ontologies to support digital manufacturing on the part of representatives from a number of branches of the advanced manufacturing industries. We here present a first draft set of axioms and definitions of an IOF upper ontology descending from BFO. The (...) axiomatization is designed to capture the meanings of terms commonly used in manufacturing and is designed to serve as starting point for the construction of the IOF ontology suite. (shrink)

The world of ontology development is full of mysteries. Recently, ISO Standard 15926 (“Lifecycle Integration of Process Plant Data Including Oil and Gas Production Facilities”), a data model initially designed to support the integration and handover of large engineering artefacts, has been proposed by its principal custodian for general use as an upper level ontology. As we shall discover, ISO 15926 is, when examined in light of this proposal, marked by a series of quite astonishing defects, which may however provide (...) general lessons for the developers of ontologies in the future. (shrink)

This paper defends a view of the Gene Ontology (GO) and of Basic Formal Ontology (BFO) as examples of what the manufacturing industry calls product-service systems. This means that they are products (the ontologies) bundled with a range of ontology services such as updates, training, help desk, and permanent identifiers. The paper argues that GO and BFO are contrasted in this respect with DOLCE, which approximates more closely to a scientific theory or a scientific publication. The paper provides a detailed (...) overview of ontology services and concludes with a discussion of some implications of the product-service system approach for the understanding of the nature of applied ontology. Ontology developer communities are compared in this respect with developers of scientific theories and of standards (such as W3C). For each of these we can ask: what kinds of products do they develop and what kinds of services do they provide for the users of these products? (shrink)

European Journal of Philosophy, Volume 30, Issue 1, Page 148-168, March 2022.

The history of evolution is a history of development from less to more complex organisms. This growth in complexity of organisms goes hand in hand with a concurrent growth in complexity of environments and of organism-environment relations. It is a concern with this latter aspect of evolutionary development that motivates the present paper. We begin by outlining a theory of organism-environment relations. We then show that the theory can be applied to a range of different sorts of cases, both biological (...) and non-biological, in which objects are lodged or housed within specific environments, or niches. Biological science is interested in types—for example in genotypes, phenotypes, and environment types—in regularities that can serve as the basis for the formulation of laws or general principles. Types, however, can exist only through their corresponding tokens. Our theory of token environments is meant to plug this gap and to provide a first step towards a general theory of causally relevant spatial volumes. (shrink)

While Darwin is commonly supposed to have demonstrated the inapplicability of the Aristotelian ontology of species to biological science, recent developments, especially in the wake of the Human Genome Project, have given rise to a new golden age of classification in which ontological ideas -- as for example in the Gene Ontology, the Cell Ontology, the Protein Ontology, and so forth -- are once again playing an important role. In regard to species, on the other hand, matters are more complex. (...) We provide a brief overview of recent proposals concerning the ontology of species, dealing with species as sets, classes and as collections, the views of Ernst Meyr, and mereological views. (shrink)

This paper develops the Value-Based Theory of Reasons in some detail. The central part of the paper introduces a number of theoretically puzzling features of normative reasons. These include weight, transmission, overlap, and the promiscuity of reasons. It is argued that the Value-Based Theory of Reasons elegantly accounts for these features. This paper is programmatic. Its goal is to put the promising but surprisingly overlooked Value-Based Theory of Reasons on the table in discussions of normative reasons, and to draw attention (...) to a number of areas for fruitful further research. (shrink)

We begin by describing recent developments in the burgeoning discipline of applied ontology, focusing especially on the ways ontologies are providing a means for the consistent representation of scientific data. We then introduce Basic Formal Ontology (BFO), a top-level ontology that is serving as domain-neutral framework for the development of lower level ontologies in many specialist disciplines, above all in biology and medicine. BFO is a bicategorial ontology, embracing both three-dimensionalist (continuant) and four-dimensionalist (occurrent) perspectives within a single framework. We (...) examine how BFO-conformant domain ontologies can deal with the consistent representation of scientific data deriving from the measurement of processes of different types, and we outline on this basis the first steps of an approach to the classification of such processes within the BFO framework. (shrink)

Mereotopology faces problems when its methods are extended to deal with time and change. We offer a new solution to these problems, based on a theory of partitions of reality which allows us to simulate (and also to generalize) aspects of set theory within a mereotopological framework. This theory is extended to a theory of coarse- and fine-grained histories (or finite sequences of partitions evolving over time), drawing on machinery developed within the framework of the so-called ‘consistent histories’ interpretation of (...) quantum mechanics. (shrink)

A study of the background of Husserl’s early thinking in the perceptual psychology of Carl Stumpf and of the implications of Stumpfian ideas for an understanding of Husserl’s phenomenology. Other topics treated include the ontology of part, whole and dependence; gestalt theory; and Husserl’s notion of the synthetic a priori.

When governments collect data relating to economic activity they commonly employ a distinction between goods and services. Both goods and services have economic value. Goods (cars, houses, bottles of milk) are, very roughly, independent continuants which can be alienated (sold, gifted, rented, and so forth). Services (hairdressing, gardening, teaching) are, again very roughly, occurrents. They are occurrents which are further often said to be marked by the fact that production and consumption coincide. Social services under both headings typically involve combinations (...) of service provision. The patterns in question are primarily those of the family (where the patterns to be maintained or restored are, roughly, those characteristic of a healthy family life) and of the child (patterns characteristic of healthy development, provided by child protective services, who work to prevent child abuse). (shrink)

Maureen Donnelly has recently argued that directionalism, the view that relations have a direction, applying to their relata in an order, is unable to properly treat certain symmetric relations. She alleges that it must count the application of such a relation to an appropriate number of objects in a given order as distinct from its application to those objects in any other ordering of them. I reply by showing how the directionalist can link the application conditions of any fixed arity (...) relation, no matter its arity or symmetry, and its converse(s) in such a way that directionalism will yield the correct ways in which it can apply. I thus establish that directionalism possesses the same advantage Donnelly's own account of relations, relative positionalism, has over traditional positionalist accounts of relations, which do not properly treat symmetric relations. I then note some advantages that directionalism has over its closest competitors. This includes Donnelly's relative positionalism, since directionalism is not, like relative positionalism, committed to the involvement of relative properties in every irreducibly relational claim. I close by conceding that, as Donnelly notes, directionalism is committed to the primitive relation of order-sensitive relational application. But I don't find this notion as mysterious as Donnelly does. I conclude that, even if one construes this feature of directionalism as a drawback, the two views are at worst at a draw, other things being equal, since this drawback is mitigated by the advantage directionalism has over relative positionalism. (shrink)

Ontology is a burgeoning field, involving researchers from the computer science, philosophy, data and software engineering, logic, linguistics, and terminology domains. Many ontology-related terms with precise meanings in one of these domains have different meanings in others. Our purpose here is to initiate a path towards disambiguation of such terms. We draw primarily on the literature of biomedical informatics, not least because the problems caused by unclear or ambiguous use of terms have been there most thoroughly addressed. We advance a (...) proposal resting on a distinction of three levels too often run together in biomedical ontology research: 1. the level of reality; 2. the level of cognitive representations of this reality; 3. the level of textual and graphical artifacts. We propose a reference terminology for ontology research and development that is designed to serve as common hub into which the several competing disciplinary terminologies can be mapped. We then justify our terminological choices through a critical treatment of the ‘concept orientation’ in biomedical terminology research. (shrink)

Plato’s partition argument infers that the soul has parts from the fact that the soul experiences mental conflict. We consider an ambiguity in the concept of mental conflict. According to the first sense of conflict, a soul is in conflict when it has desires whose satisfaction is logically incompatible. According to the second sense of conflict, a soul is in conflict when it has desires which are logically incompatible even when they are unsatisfied. This raises a dilemma: if the mental (...) conflict is supposed to be the latter kind of conflict, then the partition argument is valid but is likely unsound; if it’s supposed to be the former kind, then the partition argument has true premises but is invalid. We explain this dilemma in detail and defend a dispositionalist solution to it. (shrink)